全球政府科研機構創新25強的遴選自2016年啟動,基于科睿唯安(Clarivate Analytics,前身為湯森路透知識產權與科技事業部)的論文和專利數據,這些數據來自于InCites、Web of Science、Derwent Innovations Index、Derwent World Patents Index和Patents Citation Index等平臺。首先遴選2009-2014年間被Web of Science核心合集收錄論文最多且在世界知識產權組織(WIPO)申請的專利數不低于70的政府科研機構作為候選機構,進一步考察候選機構在申請的WIPO專利家族數、成功授權的專利比例、專利被引用的次數、與工業界合作論文的比例、機構的論文總數等指標上的表現,匯總后得到機構的整體表現,最終排名出前25位的機構。