1）知識產(chǎn)權(quán)問題
研究所技術(shù)進(jìn)入項目公司的二種方式，要么技術(shù)作價入股，要么技術(shù)許可。目前研究所在技術(shù)估值上有些浮躁，不管何種技術(shù)，市場如何，凡說到估值，少則認(rèn)為五、八百萬，多則二、三千萬，對于投資本不大（千萬以內(nèi)）的項目公司來說，不適合高作價入股。技術(shù)許可相對來說能比較快解決問題，能讓項目公司小步快跑，但一個關(guān)鍵問題是如何解決好公司后續(xù)自主研發(fā)與授權(quán)技術(shù)之間的關(guān)系問題，避免存在法律風(fēng)險。
2）研究所技術(shù)團(tuán)隊的技術(shù)認(rèn)知問題
目前院所技術(shù)人員一個通病是對自身技術(shù)在整個產(chǎn)業(yè)化過程中的作用拔得太高，而實際上從技術(shù)---樣品或樣機(jī)---標(biāo)準(zhǔn)化地批量產(chǎn)品，單純說技術(shù)的話，可能只走了30%-40%的路程，后來還有大量的路要走：
a。客戶試用過程中，往往有很多我們沒有想到的問題或缺陷，環(huán)境適應(yīng)性問題、兼容性問題、易用性問題等等。
b。量產(chǎn)穩(wěn)定性問題
c。性價比問題，當(dāng)科研人員把項目僅當(dāng)成一個一次性成果時，強(qiáng)調(diào)品質(zhì)，強(qiáng)調(diào)高指標(biāo)，在材料選擇、產(chǎn)品結(jié)構(gòu)設(shè)計、生產(chǎn)工藝上有時可以說是不計成本，而市場產(chǎn)品通常強(qiáng)調(diào)性價比，強(qiáng)調(diào)最合適的指標(biāo)以最優(yōu)的價格銷售，因此，項目公司成立之后在生產(chǎn)環(huán)節(jié)往往需要花大量時間精力，而不能簡單沿用研究所生產(chǎn)樣機(jī)的方式。
正因為單純對技術(shù)認(rèn)知太高，會忽視產(chǎn)品化其他環(huán)節(jié)，以及營銷、客戶服務(wù)、企業(yè)管理等方面的重要作用，使得研究所技術(shù)團(tuán)隊與項目公司其他部門配合重視度不夠，認(rèn)為“東西做出來了”，項目公司只管賣就可以了，賣不出去就是公司的能力問題。不接受或不承認(rèn)自己的技術(shù)和產(chǎn)品還不成熟，還不是真正的產(chǎn)品。
這類問題，如果項目公司管理層不能有效進(jìn)行協(xié)調(diào)、溝通、解決，合作方最終必定走不到一起。
3）研究所核心技術(shù)團(tuán)隊激勵問題
所有企業(yè)的成與敗，歸根到底是人的因素，好的團(tuán)隊可以把二流的技術(shù)、二流的市場做成一流的企業(yè)，差的團(tuán)隊能把一流的技術(shù)、一流的市場做成失敗的企業(yè)。項目公司成立的相當(dāng)一段時期內(nèi)，研究所原始技術(shù)團(tuán)隊必須與公司緊密合作，甚至加班加點：完善技術(shù)、調(diào)試產(chǎn)品、客戶演示、新產(chǎn)品設(shè)計開發(fā)等等，積極性何在？除了成就感之外，必須解決他們與公司利益捆綁問題，自己覺得有些奔頭或吸引力，否則說破天，效果也有限，這是人性問題。
目前存在的問題是，研究所如何平衡這些人與所內(nèi)其他人的利益問題，從公司賺多了，會不會影響他所里的獎金績效，會不會影響他正常的職業(yè)發(fā)展等等。
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